Centre documentaire

Effets de la bioturbation sur la diversité des communautés bactériennes du sédiment : approches expérimentale et in-situ : de Melinna palmata aux communautés de la vasière Ouest-Gironde

Préambule
1. Contexte bibliographique
1.1. L’interface eau-sédiment, une zone clé du fonctionnement des écosystèmes marins
1.2. La bioturbation contrôle les processus à l’interface eau-sédiment
1.3. Les communautés procaryotes de l’interface eau-sédiment contrôlées par la bioturbation
1.4. Contexte et objectifs de la thèse
2. Matériel et méthodes
2.1. Organisme modèle : Melinna palmata Grube, 1870
2.2. Les écosystèmes étudiés
2.3. Paramètres étudiés
2.4. Traitement des données et analyses statistiques
2.5. Tests de mise en évidence des communautés archéennes des sédiments par T-RFLP
3. Melinna palmata Grube 1870 : un modèle biologique pour l’étude du contrôle des communautés bactériennes de l’interface eau-sédiment par la bioturbation
3.1. Partie 1 – Melinna palmata remanie les premiers millimètres et structure les communautés bactériennes aérobies de l’interface eau-sédiment
3.2. Partie 2 – Influence des cycles tidaux, de la photopériode et de la densité de population sur l’activité de Melinna palmata
3.3. Conclusions et perspectives
4. L’enrichissement en matière organique particulaire simulant la production primaire autochtone influence le lien entre Melinna palmata et les bactéries aérobies du sédiment
4.1. Introduction
4.2. Expérimentation
4.3. Résultats
4.4. Discussion
4.5. Conclusions et perspectives
5. Les patrons spatiaux de distribution des communautés bactériennes suivent ceux de la macrofaune benthique dans la vasière Ouest-Gironde
5.1. Abstract
5.2. Introduction
5.3. Material and methods
5.4. Results
5.5. Discussion
5.6. Conclusion
6. Synthèse des résultats, conclusions et perspectives
6.1. Melinna palmata, un bon modèle biologique pour simplifier l’étude des effets de la bioturbation sur les communautés procaryotes benthiques
6.2. La macrofaune benthique influence la distribution des communautés bactériennes à l’interface eau-sédiment
6.3. Les communautés associées à Melinna palmata et à son tube
6.4. Perspectives
Références bibliographiques