Centre documentaire

Projet Seine-Aval 5

DOC1 (numérique) Impact de la dynamique particulaire sur le devenir des bactéries pathogènes dans la zone du bouchon vaseux de l’estuaire de Seine
DOC2 (numérique) Analyse spatiale de la connectivité des habitats fonctionnels pour les poissons à l’échelle de l’estuaire
DOC3 (numérique) ANPHYECO – Analyse du fonctionnement hydrologique, morphologique, sédimentaire et écologique en vue d’une recherche de pistes de restauration globale de l’estuaire de la Seine
DOC4 (numérique) ANPHYECO annexe 1 – Analyse diachronique du fonctionnement hydrosédimentaire de l’estuaire de la Seine – Contribution Ifremer au projet ANPHYECO
DOC5 (numérique) ANPHYECO annexe 2 – ANPHYECO-Seine – Hydrogeomorphology of the Seine estuary – Cubage calculation
DOC6 (numérique) ANPHYECO annexe 3 – ANPHYECO-Seine – Hydrogeomorphology of the Seine estuary – Interestuarine comparison and historical evolution
DOC7 (numérique) ANTROPOSEINE – Analyse de la structure trophique et contribution des habitats de l’estuaire de la Seine – Rapport provisoire
DOC8 (numérique) ANTROPOSEINE – Analyse de la structure trophique et contribution des habitats de l’estuaire de la Seine – Annexes du rapport de recherche
DOC9 (numérique) MOSAIC – Dynamique de la matière organique dans le bouchon vaseux de l’estuaire de Seine en lien avec les nutriments et les contaminants organiques
DOC10 (numérique) ZOOGLOBAL – Étude du zooplancton et de ses habitats estuariens dans un contexte de changement global : synthèse des acquis Seine-Aval et initiation d’une nouvelle approche intégrée
DOC11 (numérique) ZOOGLOBAL – Étude du zooplancton et de ses habitats estuariens dans un contexte de changement global : synthèse des acquis Seine-Aval et initiation d’une nouvelle approche intégrée – Annexes du rapport de recherche
DOC12 (papier) Tout s’explique ! Des travaux scientifiques qui dépassent les limites de l’estuaire

DOC1 Impact de la dynamique particulaire sur le devenir des bactéries pathogènes dans la zone du bouchon vaseux de l’estuaire de Seine
Résumé exécutif
Scientifiques ayant participé au projet
Participants au suivi de projet
Résultats

DOC2 Analyse spatiale de la connectivité des habitats fonctionnels pour les poissons à l’échelle de l’estuaire
Introduction
1 Travail préliminaire : choix des cas d’étude
1.1 Connaissance des espèces
1.2 Données géomatiques disponibles
2 Modélisation de la connectivité
2.1 Le bar commun
2.2 La truite de mer/truite fario
Conclusion générale
Avantages et limites d’une modélisation géomatique de la connectivité
Capacité à fournir une analyse cartographique des potentialités de préservation et de réhabilitation
Perspectives
Bibliographie
Annexes
1. Bilan détaillé des cas d’études analysés
2. Données et traitements géomatiques réalisés par le GIP SA (document préparé par Éric L’Ebrellec)
3. Estimations des vitesses de courant (m/s) pour les zones intertidales au cours d’un cycle de marée, flot (t1-t14), jusant (t24-t45) – Résultats des projets IBIS (Deloffre et al., 2012), DEFHFIS (Lesourd et al., 2012) utilisés pour estimer les vitesses des zones intertidales et des filandres – Les vitesses pour les vasières s’inspirent aussi de Verney et al. (2007)
4. Homogénéisation des catégories de faciès

DOC3 ANPHYECO – Analyse du fonctionnement hydrologique, morphologique, sédimentaire et écologique en vue d’une recherche de pistes de restauration globale de l’estuaire de la Seine
Introduction
1. Méthodes
1.1. Comparaison inter-estuarienne
1.2. Diachronie modélisée du fonctionnement hydro-sédimentaire
2 Diagnostic du fonctionnement écologique systémique
2.1 Résultats
Conclusion

DOC4 ANPHYECO annexe 1 – Analyse diachronique du fonctionnement hydrosédimentaire de l’estuaire de la Seine – Contribution Ifremer au projet ANPHYECO
Introduction
Mise en place et validation du modèle Sedi-MARS-3D sur la configuration 1975
– Propagation de la marée dans l’estuaire : comparaison entre hauteurs d’eau calculées et observées
– Simulation des courants de marée : comparaison entre vitesses calculées et observées
– Simulation de l’hydrologie : comparaison entre salinités calculées et observées
Mise en place et validation du modèle Sedi-MARS-3D sur la configuration 1960
– Propagation de la marée dans l’estuaire : comparaison entre hauteurs d’eau calculées et observées
Présentation des simulations réalisées pour l’analyse diachronique du fonctionnement HMS de l’estuaire de la Seine
Analyse des résultats : 1) bathymétrie et hypsométrie
Analyse des résultats : 2) propagation de la marée
Analyse des résultats : 3) courants de marée et leur asymétrie
– Courants résiduels et tendances de transport solide
– Tendances au transport de sable
Analyse des résultats : 4) hydrologie / salinités
– Temps de résidence
Analyse des résultats : 5) nature des sédiments, remises en suspension et bouchon vaseux
– Initialisation du sédiment
Conclusion
Bibliographie
Annexe 1 : devenir d’un traceur conservatif

DOC5 ANPHYECO annexe 2 – ANPHYECO-Seine – Hydrogeomorphology of the Seine estuary – Cubage calculation
Abstract
Contents
List of tables
List of figures
1. Introduction
1.1. Introduction
1.2. Outline
2. Seine estuary
3. Cubage technique
3.1. Methodology
3.2. Derived parameters
3.3. Application to the seine estuary
4. Results
4.1. Instantaneous water levels and flow velocities
4.2. Flow velocities
4.3. Tidal volumes
5. References
Appendix A

DOC6 ANPHYECO annexe 3 – ANPHYECO-Seine – Hydrogeomorphology of the Seine estuary – Interestuarine comparison and historical evolution
Abstract
Contents
List of tables
List of figures
1. Introduction
2. Methodology
2.1. Main parameters
2.2. Derived parameters
3. The Seine estuary
3.1. Morphology
3.2. The tide
3.3. Salinity
3.4. Freshwater discharge
3.5. Flow velocity
3.6. Suspended particle matter
4. Interestuarine comparison
4.1. Tidal amplification/damping and morphology
4.2. Hydrodynamics and SPM
4.3. Residence time
5. Historical evolution
5.1. Morphology
5.2. Freshwater discharge
5.3. Salinity
5.4. SPM
6. Conclusions
6.1. The present Seine
6.2. Historical evolution of the Seine
7 References
Appendix A: topo-bathymetries
Appendix B: cross-sections

DOC7 ANTROPOSEINE – Analyse de la structure trophique et contribution des habitats de l’estuaire de la Seine – Rapport provisoire
Introduction
1. Données, méthodes et innovations méthodologiques
1.1. Les modèles trophiques utilisés
1.2. Le cadre théorique et appliqué des indices ENA
1.3. Innovations méthodologiques développées dans ANTROPOSEINE
1.4. Données utilisées
2. Retour sur le cadre conceptuel : biodiversité, fonctionnement, stress, maturité (extrait de Lobry 2016)
2.1. Quelques définitions communément admises
2.2. Diversité, stabilité et maturité
3. Comparaison du fonctionnement écologique des 6 boîtes spatiales couvrant l’estuaire de la Seine et la zone d’influence dans la Baie de Seine (Tecchio et al. 2015)
3.1. Approche suivie
3.2. Résultats et discussion
3.3. Conclusion
4. Comparaison du fonctionnement écologique avant/après la construction de Port2000 (Tecchio et al. 2016 et Le Guen et al. soumis)
4.1. Introduction
4.2. Matériel et Méthodes
4.3. Résultats et discussion
4.4. Conclusion
5. Contribution des habitats estuariens à la productivité et au fonctionnement du réseau trophique de la Seine Aval : approche par modélisation Ecopath couplant les habitats
5.1. Introduction
5.2. Matériel et méthode
5.3. Résultats et discussion
5.4. Conclusion
Conclusion
– Apports et limites des données et des modèles utilisés
– Synthèse des principaux résultats obtenus
– Bilan sur les aspects opérationnels
Bibliographie
Annexes

DOC8 ANTROPOSEINE – Analyse de la structure trophique et contribution des habitats de l’estuaire de la Seine – Annexes du rapport de recherche
Incorporating food-web parameter uncertainty into Ecopath-derived ecological network indicators
The mosaic of habitats of the Seine estuary: Insights from food-web modelling and network analysis
Evaluating ecosystem-level anthropogenic impacts in a stressed transitional environment: The case of the Seine estuary

DOC9 MOSAIC – Dynamique de la matière organique dans le bouchon vaseux de l’estuaire de Seine en lien avec les nutriments et les contaminants organiques
Introduction 7
1. Stratégie d’échantillonnage
2. Description des principaux résultats
2.1. Tâche Dynamique de la matière organique
2.2. Tâche Dynamique des contaminants
2.3. Tâche Dynamique des nutriments et métabolismes
2.4. Dynamique croisée de la matière organique, des contaminants et des nutriments
Conclusion
Bibliographie
Annexes

DOC10 ZOOGLOBAL – Étude du zooplancton et de ses habitats estuariens dans un contexte de changement global : synthèse des acquis Seine-Aval et initiation d’une nouvelle approche intégrée
Introduction
1. Synthèse des acquis Seine-Aval autour des copépodes
1.1. Synthèse de données acquises sur le terrain : échantillonnage à haute fréquence
1.2. Modélisation de l’habitat fonctionnel des copépodes Eurytemora affinis et Acartia sp.
1.3. Effets de la température, la salinité et l’acclimatation sur la plasticité et la fitness du copépode Eurytemora affinis : approche expérimentale
2. Effets des facteurs naturels et de la qualité de l’eau sur la dynamique et le rôle trophique du zooplancton
2.1. Introduction
2.2. Suivi in situ du zooplancton dans la zone de gradient de salinité
2.3. Activité trophique du zooplancton
3. Utilisation des copépodes estuariens comme bio-senseurs de leur milieu
3.1. Introduction : importance du comportement natatoire dans l’écologie des copépodes
3.2. Approche expérimentale : utilisation de la vélocimétrie en trois dimensions
3.3. Étude du comportement natatoire des copépodes en milieu turbulent
3.4. Étude de la toxicité comportementale chez les copépodes
3.5. Lien avec la définition des habitats de copépodes et perspectives
Conclusion
Bibliographie
Annexes

DOC11 ZOOGLOBAL – Étude du zooplancton et de ses habitats estuariens dans un contexte de changement global : synthèse des acquis Seine-Aval et initiation d’une nouvelle approche intégrée – Annexes du rapport de recherche
1. Application de l’approche de paramétrisation de l’effet de la salinité sur la densité des copépodes E. affinis et T. longicornis à partir des données issues de la thèse de P. Mouny
2. Ontogenetic optimal temperature and salinity envelops of the copepod Eurytemora affinis in the Seine estuary (France)
3. Extrait de la nouvelle page Web du projet MOBIDYC après sa migration de l’INRA vers un site CNRS hébergé par le LOG sous la responsabilité de S. Souissi

DOC12 Tout s’explique ! Des travaux scientifiques qui dépassent les limites de l’estuaire
Une structuration scientifique à l’échelle du bassin de la Seine
De Paris à la mer, un suivi haute fréquence de la qualité de l’eau
La crue de juin 2016, un retour d’expérience partagé à l’échelle de la Seine
Une pollution importante de l’estuaire par les macrodéchets plastiques
Les microplastiques, une présence confirmée dans la Seine
Un impact majeur du système agroalimentaire sur la qualité des eaux de la Seine
Vers une continuité piscicole sur le bassin de la Seine
Une coordination nationale pour la recherche sur les estuaires français
Des organismes aquatiques utilisés pour suivre la qualité de l’eau